Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTATSF1O43719 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms