Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HTRA2O43464 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HTRA2O43464 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms