Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA2O43364 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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