Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF6O14896 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF6O14896 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF6O14896 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF6O14896 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF6O14896 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms