Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD8O14715 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms