Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ELL2O00472 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ELL2O00472 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ELL2O00472 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ELL2O00472 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ELL2O00472 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ELL2O00472 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms