Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN25C9JDP6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms