Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms