Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC169A6NNP5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms