Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA8JA6NMD2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms