Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD3A6NKT7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD3A6NKT7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD3A6NKT7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms