Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC4A6NH21 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms