Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOLGA6CA6NDK9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms