Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF22A3QJZ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms