Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC78A2IDD5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms