Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HDAC11Q96DB2 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HDAC11Q96DB2 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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