Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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PDK4Q16654 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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