Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC123768.2-201ENST00000500941 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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