Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A6Q14031 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms