Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC02544-201ENST00000564830 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SMYD1-202ENST00000438570 680 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC084876.1-201ENST00000612793 641 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms