Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL7P21-201ENST00000478287 635 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FAXDC2-206ENST00000518651 536 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 C16orf45-203ENST00000561692 534 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZSCAN26-203ENST00000611552 1030 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC024610.2-203ENST00000636084 1348 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GLYATL2-202ENST00000532258 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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