Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL390728.4-201ENST00000421406 1465 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 IL15-202ENST00000320650 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PACRG-203ENST00000366889 1503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CYP2C58P-201ENST00000436281 475 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P31-201ENST00000448627 970 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CASQ1-202ENST00000467691 595 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P8-201ENST00000482081 580 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC01965-202ENST00000537492 552 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL352979.1-201ENST00000554238 297 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC244669.1-201ENST00000616141 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC003684.1-201ENST00000432442 1715 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL122008.2-201ENST00000412915 570 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms