Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007336.2-201ENST00000611626 557 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FOLR2-210ENST00000619261 1126 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC092656.1-201ENST00000503243 2097 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CARF-216ENST00000444724 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL008638.1-201ENST00000430468 473 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC007879.1-201ENST00000435643 554 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P2-201ENST00000438540 808 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC02037-201ENST00000455821 1195 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TRIM2-207ENST00000482578 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-36-201ENST00000520848 401 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-7-201ENST00000522952 271 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC018618.1-202ENST00000559590 395 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC009120.2-202ENST00000566411 679 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AP005229.1-201ENST00000592198 810 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC015574.1-201ENST00000615194 489 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC009120.2-201ENST00000620711 522 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 LINC01206-219ENST00000625703 820 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM20-202ENST00000614577 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MASP1-202ENST00000296280 4015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 MFSD1P1-201ENST00000576210 1327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC090984.1-201ENST00000623172 1332 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CSPP1Q1MSJ5 RAB19-201ENST00000356407 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms