Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms