Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLIC4Q9Y696 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC4Q9Y696 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC4Q9Y696 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC4Q9Y696 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC4Q9Y696 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLIC4Q9Y696 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms