Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNX8Q9Y5X2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms