Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM17Q9Y577 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms