Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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