Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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