Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL11Q9Y3B7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL11Q9Y3B7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms