Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEMD3Q9Y2U8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEMD3Q9Y2U8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms