Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNQ9UQP3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNQ9UQP3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms