Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPCN1Q9ULQ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPCN1Q9ULQ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPCN1Q9ULQ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPCN1Q9ULQ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPCN1Q9ULQ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPCN1Q9ULQ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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