Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA3Q9UL41 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA3Q9UL41 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms