Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms