Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms