Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms