Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC24A2Q9UI40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms