Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP25Q9UHP3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms