Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms