Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPARGC1AQ9UBK2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms