Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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