Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3BP4Q9P0V3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3BP4Q9P0V3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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