Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1Q9NZ71 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1Q9NZ71 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms