Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA3Q9NZ52 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms