Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23BQ9NYZ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms