Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DLL3Q9NYJ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms