Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHBDL2Q9NX52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms