Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms