Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms